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        <dc:description xml:lang="en">&lt;html&gt;&lt;body&gt;&lt;title&gt;AT1G66630.1&lt;/title&gt;(&amp;uarr; Click "Links", if this line appears at the beginning.)&lt;br&gt;&lt;H1&gt;Other supporting information&lt;/H1&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan="2" align="left"&gt;&lt;b&gt;Gene Model&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP width="75"&gt;&lt;/td&gt;&lt;td NOWRAP&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u126663001000i/AT1G66630.1.gene_models.png" width="717"&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=2 align="left"&gt;&lt;b&gt;Correlation Plot&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP colspan="2" align="left"&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u126663001000i/AT1G66630.1.CorrPlot.jpg" width="800"&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Expression profile (Values are plotted in Log(2) values.)&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u126663001000i/AT1G66630.1.F0.Expression.png"&gt;&lt;br&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Genes with related expresssion profiles.&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;table border=1&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Positively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u223198101000i"&gt;AT2G31981.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.803339&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u220659001000i"&gt;AT2G06590.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.734447&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u520988001000i"&gt;AT5G09880.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.732274&lt;/td&gt;&lt;td&gt;RNA recognition motif (RRM)-containing protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u223308001000i"&gt;AT2G33080.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.702863&lt;/td&gt;&lt;td&gt;AtRLP28 (Receptor Like Protein 28)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u321881501000i"&gt;AT3G18815.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.701861&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pre-tRNA&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u522703501000i"&gt;AT5G27035.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.69972&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u223573001000i"&gt;AT2G35730.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.696504&lt;/td&gt;&lt;td&gt;heavy-metal-associated domain-containing protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT2P108050&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u523874001000i"&gt;AT5G38740.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.695999&lt;/td&gt;&lt;td&gt;AGL77 (AGAMOUS-LIKE 77)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u525674501000i"&gt;AT5G56745.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.684749&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pre-tRNA&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u321551801000i"&gt;AT3G15518.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.677919&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P005690&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P105220&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Negatively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u220275001000i"&gt;AT2G02750.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.809419&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u126410002000i"&gt;AT1G64100.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.806798&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P017600&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u525516002000i"&gt;AT5G55160.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.777564&lt;/td&gt;&lt;td&gt;SUMO2 (SMALL UBIQUITIN-LIKE MODIFIER 2)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P114370&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u122132301000i"&gt;AT1G21323.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.764582&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u124783001000i"&gt;AT1G47830.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.727995&lt;/td&gt;&lt;td&gt;clathrin coat assembly protein, putative&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P111570&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u325301501000i"&gt;AT3G53015.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.718269&lt;/td&gt;&lt;td&gt;MIR771a&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u390000060000i"&gt;ath-MIR771&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.718269&lt;/td&gt;&lt;td&gt;ath-MIR771&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u421859301000i"&gt;AT4G18593.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.715224&lt;/td&gt;&lt;td&gt;dual specificity protein phosphatase-related&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT4P005635&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u220782702000i"&gt;AT2G07827.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.713104&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u123665001000i"&gt;AT1G36650.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.699185&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;a href="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u126663001000i/AT1G66630.1-correlation.txt"&gt;Get whole results&lt;/a&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt; &lt;HR&gt;&lt;b&gt;Over-Representation Analysis Result&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr bgcolor=#FF69B4&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;:20 terms with high significance&lt;/td&gt;&lt;/a&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFACD&gt;&lt;td&gt;1.00e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 8.76e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;                  :With considering multiple testing correction;&lt;br&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt; &lt;=  1.00e-02 / 1142&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;8.76e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-02&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Type of term (*1)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Depth of the term in ontology tree&lt;/th&gt;&lt;th&gt;ID/Term&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Description&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Number of genes&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Over-Representative rate (*2)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*3)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PosMed &lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*4)&lt;br&gt; (Link to PosMed)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Found on gene annotation&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;PS&lt;/td&gt;&lt;td&gt;4&lt;/td&gt;&lt;td&gt;PO:0006345&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pollen tube&lt;/td&gt;&lt;td&gt;43/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.48&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.99e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor="#555555" height="10"&gt;&lt;td colspan="9"&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;PG&lt;/td&gt;&lt;td&gt;5&lt;/td&gt;&lt;td&gt;PO:0007605&lt;/td&gt;&lt;td&gt;androecium developmental stages&lt;/td&gt;&lt;td&gt;44/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.50&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.89e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor="#555555" height="10"&gt;&lt;td colspan="9"&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;anthesis&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;24/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.83&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.52e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;oxidoreductase&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;11/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.36&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.70e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;[PS]:Plant Structure(Plant ontology), [PG]:Growth and developmental stages(Plant ontology), [KW]:words found in gene description.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*2)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;([# of genes with the term] / [# of sampling (200)]) / ([# of genes with the term among whole genes] / [# of whole genes])          &lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;P-values were calculated on hypergeometric distribution in which we found &lt;i&gt;n&lt;/i&gt; genes with a annotation term during 200           highly correlated genes, while we had &lt;i&gt;N&lt;/i&gt; genes           with the term in the whole genes.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*4)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="http://omicspace.riken.jp/PosMed-plus/"&gt;PosMed&lt;/a&gt; is a system which serve a p-values showing a relationship           between the gene and the annotation term based on literature information and Gene-Gene interaction suchas co-expression or           protein-protein interactions.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s904i"&gt;Top Page&lt;/a&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</dc:description>
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